نرم افزار الیگو 7 برای طراحی پرایمر oligo 7

بیوتکنولوژی

1396/11/19
199
0

برچسب ها:

 Oligo7 نرم افزاری بسیار کاربردی برای انجام آنالیزهایی بر روی ژن ها و طراحی پرایمر برای انجام واکنش PCR است.

ویژگی های اصلی نرم افزار Oligo:
- طراحی پرایمر ها به صورت خودکار
- امکان طراحی پرایمر به صورت دستی
- بررسی تشگیل ساختارهای ثانویه و سنجاق سری در پرایمر ها
- تجزیه و تحلیل پرایمرهای پی سی آر
- طراحی و تجزیه و تحلیل انواع پروب ها
- نمایش ترکیب های مفید هر پرایمر


آموزش طراحی پرایمر: بررسی کیفیت پرایمر ها

سوال: در صورت انتخاب پرایمرها از یک مقاله و یا دریافت توالی پرایمر از سایر منابع،

- چگونه می توان که دمای Tm واقعی پرایمرها را مشخص نمود؟

- چگونه می توان تشکیل ساختارهای ثانویه در پرایمرها مانند تشکیل هترودوپلکس و ساخنار سنجاق سری بین پرایمرها را بررسی نمود؟

- در روش هایی مثل tetra-ARMs که از 4 عدد پرایمر استفاده می گردد. چگونه می توان به صورت همزمان تشکیل ساختارهای ثانویه در بیش از 2 پرایمر را بررسی نمود.

جواب:
با استفاده از نرم افزار IDT يا همان Oligo analyzer ، می توان که تمام ويژگي هاي پرايمر را از نظر تشکيل self-dimer و hetero-dimer و hair-pin و دمای Tm را برای یک پرایمر یا چندیدن پرایمر به صورت همزمان بررسي نمود.

 

قبل از نصب این برنامه حتما نرم افزار Java SE Runtime Environment (JRE) را دانلود و نصب نمایید در غیر این صورت نرم افزار الیگو اجرا نخواهد شد.

منبع :پیشگام بیوفرماتک

 

در ادامه میتوانید فایل نرم افزار oligo7 را دانلود کنید

اشتراک گذاری

نظرات